中华人民共和国太仓海事局经中央机构编制委员会办公室（中央编办复字［2010］第152号）批复成立，于2010年7月19日揭牌成立，为江苏海事局正处级分支机构。
太仓海事局的前身是江苏太仓海事处，于2001年1月18日成立。
根据上级批复，太仓海事局设立办公室、人事教育处、装备信息处、财务会计处、执法督察处、党群工作部（纪委办公室）、指挥中心（搜救中心办公室、通航管理处、海巡执法支队）、危管防污处、政务中心（船舶监督处）、浏河海巡执法大队、浮桥海巡执法大队、璜泾海巡执法大队等12个机构。
辖区长江岸线38.8公里，管辖范围上界自白茆河口与崇明岛上端连线，与常熟海事局、南通海事局交界；下界至浏黑屋与崇明岛施翘河信号杆连线与上海海事局宝山、崇明海事局交界。
机构职能：
一、贯彻和执行国家海洋管理､环境保护､水上交通安全､航海保障､船舶和水上设施检验等方面的法律､法规和规章。
二、按照授权,负责辖区内船舶登记工作;负责规定范围内船舶法定配备的操作性手册与文书审核签发工作;负责受理外国籍船舶(包括港澳地区船舶)进入本辖区未开放水域或港口的申请工作,并上报上级海事机构。
三、按照授权,负责辖区内船员和海上设施工作人员适任资格､培训､考试和发证管理工作､船员服务簿发放及管理､船员专业与特殊培训管理及考试发证工作。
四、负责组织辖区内船舶防台､水上搜寻救助工作;按照管理权限,负责辖区水上交通事故､船舶污染事故､水上交通违章案件的调查处理工作。
五、按照授权,负责实施辖区内港口国管理､船舶安全检查､国际航行船舶进出口岸查验､国内航行船舶进出港签证､强制引航监督､船舶载运危险货物及其他货物的安全监督､靠泊安全监督､防治船舶污染水域监督等工作。
六、负责辖区内通航环境管理与通航秩序维护工作;按照授权,负责辖区水上水下施工安全技术状况审核､锚地和重要水域划定､港区岸线使用审核､航行警(通)告发布等工作。
七、按照管理权限,负责本局机关和所属机构的海事业务､法制､财务､资产､规费征收､基本建设､干部人事､劳动工资､计划装备､科技教育､党群和精神文明建设等工作。
八、承办中华人民共和国江苏海事局交办的其他事项。